MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894 chromosome

Total Repeats: 107831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013530	CCGC	2	8	220	227	0 %	0 %	25 %	75 %	269954811
2	NC_013530	ACCT	2	8	312	319	25 %	25 %	0 %	50 %	269954811
3	NC_013530	TCC	2	6	357	362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269954811
4	NC_013530	GAG	3	9	456	464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269954811
5	NC_013530	GAC	2	6	465	470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954811
6	NC_013530	GCC	2	6	485	490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954811
7	NC_013530	GCCGA	2	10	516	525	20 %	0 %	40 %	40 %	269954811
8	NC_013530	GCC	2	6	594	599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954811
9	NC_013530	GTCGCC	2	12	600	611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269954811
10	NC_013530	CTG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954811
11	NC_013530	GTGCGG	2	12	723	734	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269954811
12	NC_013530	GAG	2	6	747	752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269954811
13	NC_013530	TCA	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269954811
14	NC_013530	AAG	2	6	786	791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269954811
15	NC_013530	GCG	2	6	806	811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954811
16	NC_013530	CGACGT	2	12	818	829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269954811
17	NC_013530	CCT	2	6	830	835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269954811
18	NC_013530	CGA	2	6	839	844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954811
19	NC_013530	GGA	2	6	878	883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269954811
20	NC_013530	TTC	2	6	885	890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269954811
21	NC_013530	GCC	2	6	947	952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954811
22	NC_013530	AGC	2	6	955	960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954811
23	NC_013530	GCC	2	6	1022	1027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954811
24	NC_013530	AAG	2	6	1059	1064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269954811
25	NC_013530	CCA	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269954811
26	NC_013530	GC	3	6	1150	1155	0 %	0 %	50 %	50 %	269954811
27	NC_013530	CAG	2	6	1191	1196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954811
28	NC_013530	TGC	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954811
29	NC_013530	TCA	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269954811
30	NC_013530	CGA	3	9	1241	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954811
31	NC_013530	CGT	2	6	1271	1276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954811
32	NC_013530	GCC	2	6	1290	1295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954811
33	NC_013530	GCTCGC	2	12	1330	1341	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269954811
34	NC_013530	CAG	2	6	1419	1424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954811
35	NC_013530	CGG	2	6	1427	1432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954811
36	NC_013530	ACCAC	2	10	1438	1447	40 %	0 %	0 %	60 %	269954811
37	NC_013530	CAA	2	6	1460	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269954811
38	NC_013530	CAG	2	6	1539	1544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954811
39	NC_013530	GCAC	2	8	2162	2169	25 %	0 %	25 %	50 %	269954812
40	NC_013530	CCG	2	6	2183	2188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954812
41	NC_013530	TCA	2	6	2235	2240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269954812
42	NC_013530	GCC	2	6	2325	2330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954812
43	NC_013530	CG	4	8	2344	2351	0 %	0 %	50 %	50 %	269954812
44	NC_013530	GGT	2	6	2395	2400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269954812
45	NC_013530	GCG	2	6	2409	2414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954812
46	NC_013530	CGA	2	6	2548	2553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954812
47	NC_013530	CGCTGC	2	12	2556	2567	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269954812
48	NC_013530	GCT	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954812
49	NC_013530	ACCG	2	8	2618	2625	25 %	0 %	25 %	50 %	269954812
50	NC_013530	CGCC	2	8	2658	2665	0 %	0 %	25 %	75 %	269954812
51	NC_013530	CCG	2	6	2679	2684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954812
52	NC_013530	GCGG	2	8	2735	2742	0 %	0 %	75 %	25 %	269954812
53	NC_013530	CGG	2	6	2803	2808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954812
54	NC_013530	ACG	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954812
55	NC_013530	TCG	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954812
56	NC_013530	CCG	2	6	2854	2859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954812
57	NC_013530	CGT	2	6	2890	2895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954812
58	NC_013530	CCCA	2	8	2897	2904	25 %	0 %	0 %	75 %	269954812
59	NC_013530	CGC	2	6	2924	2929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954812
60	NC_013530	TCG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954812
61	NC_013530	GGT	2	6	2986	2991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269954812
62	NC_013530	CGA	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954812
63	NC_013530	TGG	2	6	3048	3053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269954812
64	NC_013530	CTC	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269954812
65	NC_013530	CCT	2	6	3214	3219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269954812
66	NC_013530	AGCA	2	8	3290	3297	50 %	0 %	25 %	25 %	269954813
67	NC_013530	CAA	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269954813
68	NC_013530	GGC	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954813
69	NC_013530	CGC	2	6	3425	3430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954813
70	NC_013530	CGGC	2	8	3452	3459	0 %	0 %	50 %	50 %	269954813
71	NC_013530	GTC	2	6	3462	3467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954813
72	NC_013530	CCG	2	6	3481	3486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954813
73	NC_013530	CG	3	6	3496	3501	0 %	0 %	50 %	50 %	269954813
74	NC_013530	GCG	2	6	3535	3540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954813
75	NC_013530	TCG	3	9	3544	3552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954813
76	NC_013530	GGT	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269954813
77	NC_013530	GCC	2	6	3591	3596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954813
78	NC_013530	GTG	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269954813
79	NC_013530	GGGTG	2	10	3641	3650	0 %	20 %	80 %	0 %	269954813
80	NC_013530	GGCG	2	8	3680	3687	0 %	0 %	75 %	25 %	269954813
81	NC_013530	CGA	3	9	3692	3700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954813
82	NC_013530	CG	3	6	3748	3753	0 %	0 %	50 %	50 %	269954813
83	NC_013530	CCGGT	2	10	3772	3781	0 %	20 %	40 %	40 %	269954813
84	NC_013530	GCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954813
85	NC_013530	CGC	2	6	3866	3871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954813
86	NC_013530	TCA	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269954813
87	NC_013530	GCACG	2	10	3893	3902	20 %	0 %	40 %	40 %	269954813
88	NC_013530	GTG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269954813
89	NC_013530	GGA	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269954813
90	NC_013530	GAC	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954813
91	NC_013530	GGC	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954813
92	NC_013530	CCG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954813
93	NC_013530	AGG	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269954813
94	NC_013530	GGC	2	6	4139	4144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954813
95	NC_013530	CAG	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954813
96	NC_013530	CGG	2	6	4160	4165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954813
97	NC_013530	TC	3	6	4370	4375	0 %	50 %	0 %	50 %	269954814
98	NC_013530	CGTC	2	8	4399	4406	0 %	25 %	25 %	50 %	269954814
99	NC_013530	TCGAGC	2	12	4411	4422	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269954814
100	NC_013530	TCG	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954814
101	NC_013530	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
102	NC_013530	CGT	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954814
103	NC_013530	CG	3	6	4626	4631	0 %	0 %	50 %	50 %	269954814
104	NC_013530	CGGA	2	8	4741	4748	25 %	0 %	50 %	25 %	269954814
105	NC_013530	CGC	2	6	4749	4754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954814
106	NC_013530	GCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954814
107	NC_013530	TCG	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954814
108	NC_013530	CTC	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269954814
109	NC_013530	CG	4	8	4789	4796	0 %	0 %	50 %	50 %	269954814
110	NC_013530	GCT	2	6	4802	4807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954814
111	NC_013530	GCT	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954814
112	NC_013530	GGC	2	6	4922	4927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954814
113	NC_013530	CGG	2	6	4934	4939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954814
114	NC_013530	CGG	2	6	4993	4998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954814
115	NC_013530	CCTG	2	8	5066	5073	0 %	25 %	25 %	50 %	269954814
116	NC_013530	ACG	2	6	5074	5079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
117	NC_013530	G	6	6	5093	5098	0 %	0 %	100 %	0 %	269954814
118	NC_013530	GCG	2	6	5100	5105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954814
119	NC_013530	TCC	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269954814
120	NC_013530	CCG	2	6	5133	5138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954814
121	NC_013530	CTG	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954814
122	NC_013530	GGC	2	6	5177	5182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954814
123	NC_013530	CG	3	6	5183	5188	0 %	0 %	50 %	50 %	269954814
124	NC_013530	AGG	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269954814
125	NC_013530	CGA	2	6	5234	5239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
126	NC_013530	TCGCGC	2	12	5305	5316	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269954814
127	NC_013530	CGT	2	6	5326	5331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954814
128	NC_013530	CCT	2	6	5336	5341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269954814
129	NC_013530	CGG	2	6	5342	5347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954814
130	NC_013530	GAC	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
131	NC_013530	GAC	2	6	5376	5381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
132	NC_013530	GAC	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
133	NC_013530	CGA	2	6	5411	5416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
134	NC_013530	CGA	2	6	5429	5434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
135	NC_013530	CGG	2	6	5452	5457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954814
136	NC_013530	CGG	2	6	5467	5472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954814
137	NC_013530	GCCC	2	8	5566	5573	0 %	0 %	25 %	75 %	269954814
138	NC_013530	GAG	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269954814
139	NC_013530	ACG	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
140	NC_013530	CGA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
141	NC_013530	GCC	2	6	5674	5679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954814
142	NC_013530	CGA	2	6	5741	5746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954814
143	NC_013530	CGT	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954814
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145	NC_013530	C	6	6	5868	5873	0 %	0 %	0 %	100 %	269954815
146	NC_013530	CG	3	6	5883	5888	0 %	0 %	50 %	50 %	269954815
147	NC_013530	GCG	2	6	5890	5895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954815
148	NC_013530	CGC	2	6	5960	5965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269954815
149	NC_013530	TCG	2	6	5966	5971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954815
150	NC_013530	CG	4	8	6000	6007	0 %	0 %	50 %	50 %	269954815
151	NC_013530	CGT	2	6	6027	6032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954815
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155	NC_013530	CGT	2	6	6084	6089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954815
156	NC_013530	CGA	2	6	6114	6119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954815
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159	NC_013530	GCT	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954815
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167	NC_013530	CGG	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954816
168	NC_013530	CGT	2	6	6873	6878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954816
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171	NC_013530	CGG	2	6	6975	6980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954816
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175	NC_013530	CGG	2	6	7104	7109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269954816
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249	NC_013530	GCGG	2	8	10035	10042	0 %	0 %	75 %	25 %	269954817
250	NC_013530	GCT	2	6	10053	10058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954817
251	NC_013530	CGA	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954817
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253	NC_013530	ATC	2	6	10135	10140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269954817
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256	NC_013530	TCG	2	6	10241	10246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954817
257	NC_013530	CGA	2	6	10257	10262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954817
258	NC_013530	CGCA	2	8	10267	10274	25 %	0 %	25 %	50 %	269954817
259	NC_013530	TCC	2	6	10277	10282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269954817
260	NC_013530	ACG	2	6	10286	10291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954817
261	NC_013530	GGA	2	6	10305	10310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269954817
262	NC_013530	GAG	3	9	10321	10329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269954817
263	NC_013530	GTC	3	9	10330	10338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269954817
264	NC_013530	CG	3	6	10346	10351	0 %	0 %	50 %	50 %	269954817
265	NC_013530	CAG	2	6	10390	10395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954817
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267	NC_013530	GAC	2	6	10438	10443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954817
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271	NC_013530	CAC	2	6	10474	10479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269954817
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283	NC_013530	CGA	2	6	10923	10928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954817
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383	NC_013530	CGCA	2	8	14916	14923	25 %	0 %	25 %	50 %	269954822
384	NC_013530	CAC	2	6	14927	14932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269954822
385	NC_013530	GAC	3	9	14934	14942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269954822
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